南巨摩郡(みなみこまぐん)は、山梨県国中地方南端の郡である。
身延町(みのぶちょう)、早川町(はやかわちょう)、南部町(なんぶちょう)、富士川町(ふじかわちょう)の4町で構成される。
現在の郡域のうち、富士川以東は過去に西八代郡に属していた。