長屋神社（ながやじんじゃ）は、岐阜県本巣市にある神社である。
創建については不明。ただ、もとは杉之社にあったといわれ、天文元年（1532年）に大野郡相羽城主・長屋景興が現在の地に移したといわれている。しかし、その後は社運に恵まれずに衰退し、元禄4年（1691年）に大垣藩主の戸田氏が再建したという。慶応4年（1868年）、長屋牛頭天王と改めたものの、翌年には現在の社名に復した。
毎年8月1日と8月2日には例祭が行われるが、その際の「馬かけ祭り」は有名である。
