新治郡衙跡(にいはりぐんがあと)とは、現在の茨城県筑西市古郡478に存在した古代の郡役所跡である。
新治駅の北およそ2キロの地点にある。
大化の改新以後に設置された新治郡の郡役所で、現在は台地の畑の中に多くの建物の礎石が残されている。国の史跡に指定されている。