善学院(ぜんがくいん)は、山梨県南巨摩郡身延町にある身延山久遠寺にかつて存在した塔頭寺院。檀林の一つで、西谷檀林とも呼ばれていた。
1614年(慶長19年)、心性院日遠が善学院日鏡の隠棲地に開いたのを起源とする。日遠を初代化主とする。1874年(明治7年)に閉鎖され甲府に移転し廃止となった。直接的な後身ではないが、身延山大学はその伝統を受け継いでいるとしている。