有機水銀化合物は、水銀を含む有機物である。多くは強い神経毒性を持ち、オレイン酸水銀を除く有機水銀化合物は医薬用外毒物に指定されている。ところが、有機水銀化合物は消毒用マーキュロクロム液(赤チン)やワクチン添加用チメロサールにも使われている。
有機水銀化合物の毒性が広く知られたのは、水俣病のメチル水銀が原因であろう。また、毒性が最も強い有機水銀化合物はジメチル水銀である。
マグロなどへの生物濃縮にも注意がいる。
