巌南堂書店(がんなんどうしょてん)は東京都千代田区の古書店であり、出版も執り行う。
学術書の普及と刊行を目指して1947年(昭和22年)5月に立ち上げた。学術書の輸出や輸入のための巌南堂貿易もある。
出版内容は地方史に関するものや書誌学に関する書籍に集中している。
『日本書誌の書誌』『地方史文献総合目録』(全三巻)