法華岳薬師寺（ほっけだけやくしじ）とは、宮崎県東諸県郡国富町深年4050に存在する寺院である。
国富町の北西部、深年川中流部に沿う法華岳集落背後の海抜200メートル余りの山上にある寺院である。
開基の年代やその寺歴に関してはほとんど不明だが、平安時代の歌人として知られる和泉式部がここに参篭したという伝説があり、日本三薬師の1つに数えられている。
本尊の薬師如来及び両脇侍像と、これを安置する須弥壇が、宮崎県の文化財に指定されている。