山本 拓矢（やまもと たくや）は、日本の化学者。北海道大学大学院工学研究院准教授。
1999年5月にユタ大学卒業。2004年12月に化学部の卒業過程を修了した。
2005年4月に科学技術振興機構 ERATO 相田ナノ空間プロジェクト研究員、同年10月に科学技術振興機構 ERATO-SORST 相田ナノ空間プロジェクト研究員となる。2008年7月より、東京工業大学 大学院理工学研究科 助教授となる。2015年10月より、北海道大学 大学院工学研究院 准教授となる。
2013年4月、文部科学大臣表彰 若手科学者賞を受賞している。
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