クロヨシノボリ(Rhinogobius brunneus)とは、ハゼ目ハゼ科のヨシノボリの一種である。
全長8cm。体色は黒。
特に繁殖期になると黒くなり、体側にオレンジ色の斑、尾鰭の縁が黄色くなる。
北海道から南西諸島に分布する。
藻類や水生昆虫を食べる。
雄が砂に埋まった石の下に産卵室をつくり、雌を誘う。
雄が孵化するまで卵の世話をする。孵化した幼魚は海へ行き、成長すると川に戻る。
一生淡水域で過ごす陸封型の個体もいる。
2年後で成熟する。